Miljøprojekt nr. 757, 2003 Optimering og validering af metode til påvisning af Cryptosporidium og Giardia i drikkevandIndholdsfortegnelseForordProjektet er udført i 2001-2002 for Miljøstyrelsen med henblik på optimering og validering af en metode til påvisning af protozoerne, Cryptosporidium og Giardia, i rent vand samt råvand. Metoden er baseret på filtrering af vandet og efterfølgende oprensning vha. immunomagnetisk separation. Detektion af protozoerne sker vha. immunofluorescens. Formålet med nærværende studie er at bestemme genfindelsen af hhv. Cryptosporidium oocyster og Giardia cyster under anvendelse af ovennævnte metode samt at foretage et kvalificeret skøn over metodens sensitivitet m.h.p. fremtidig brug ved vurdering af protozo koncentrationen i forskellige vandprøver. Rapporten er udarbejdet af: Der er i forbindelse med udarbejdelse af projektet nedsat en følgegruppe med følgende deltagere: Miljøstyrelsen v/ Linda Bagge (Formand) SammendragFormålet med dette projekt var at optimere og validere en metode til opkoncentrering, oprensning og efterfølgende identifikation af protozoerne Cryptosporidium og Giardia i henholdsvis råvand og rent vand. Baggrund Interessen for at kende status for vandets indhold af protozoerne er bl.a. baseret på beskrivelsen af omfattende vandbårne epidemier forårsaget af Cryptosporidium og Giardia i drikkevand. Herved er opstået en stigende interesse for udvikling og optimering af metoder til påvisning af disse zoonotiske parasitter i forskellige materialer, herunder råvand og drikkevand. Cryptosporidium parvum og Giardia lamblia (syn. G. intestinalis og G. duodenalis) er encellede parasitter, der kan inficere mavetarm-kanalen hos såvel mennesker som dyr. Parasitterne er ubikvitært forekommende i naturen og blandt de almindeligste ikke-bakterielle årsager til diarré. Cryptosporidier udskilles via fæces som oocyster og i meget store mængder. Oocysterne er straks infektive og endvidere modstandsdygtige overfor alle almindeligt anvendte desinfektionsmidler herunder klor i koncentrationer, der kan anvendes til behandling af drikke- / badevand. I køligt, fugtigt miljø kan oocysterne overleve flere måneder. Smitte finder sted ved direkte kontakt (person-person, dyr-menneske) eller indirekte via optagelse af oocyster fra bl.a. drikkevand, badevand og levnedsmidler forurenet med fækalier. Giardiasis hos mennesker forårsages af arten G. lamblia, der i lighed med C. parvum har et meget bredt værtsspektrum. Livscyklus omfatter to stadier: Trophozoit stadiet, som er det infektive stadium og cyste stadiet, som er den resistente form, der udskilles med fæces. Cysten kan overleve op til 2 måneder udenfor værten. For begge protozoer er få (oo)cyster tilstrækkeligt til at give sygdom. Metoden I det nærværende studie er en metode til påvisning af Cryptosporidium oocyster og Giardia cyster blevet optimeret og valideret. Metoden er valideret via bestemmelse af genfindelsesprocenten ved tilsætning af kendte mængder oocyster og cyster i forskellige koncentrationer til vandprøverne. Til valideringen er anvendt 6 vandprøver af forskellig kvalitet: Tre rentvandsprøver fra hhv. Kingosvej, Mørkskov og Regnemark vandværk, samt 3 råvandsprøver fra Kingosvej og Mørkskov vandværk tillige med Ejby råvandsboring. For hver vandprøve er der foretaget 10 filtreringer à 10 liter med hver af de følgende cyste/oocyste koncentrationer: 100, 1000 og 10.000. For hver 10. filtrering blev der medtaget en positiv kontrol (5 l milli-Q eller ionbyttet vand tilsat det samme antal cyster/oocyster som de forudgående vandprøver: 100, 1000 eller 10.000) og en negativ kontrol(5 l milli-Q eller ionbyttet vand). Vandprøverne er blevet filtreret gennem et 2 µm membranfilter, opkoncentreret vha. centrifugering og immunomagnetisk separation (IMS), og sluttelig farvet og aflæst vha. immunofluorescens. I forbindelse med projektet blev metoderne til opkoncentrering og detektion af Cryptosporidium og Giardia i vandprøver optimeret på forskellige punkter: Ved filtreringsprocessen sikredes udskiftning af gummislanger så disse var garanteret protozo-fri. Ved frigørelse af oocyster/cyster fra filtret i den anvendte 'pulsifier' justeredes vandmængde og procedure for at minimere tab af ocyster/cyster. Filtratopkoncentrering foregik ved ændret indstilling af centrifugeringen - og mikroskoperingsprocessen justeredes efter prøvens indhold af (oo)cyster. Som led i valideringen blev det undersøgt, hvorvidt der var interaktion mellem Giardia og Cryptosporidium, idet eksempelvis høj koncentration af den ene art kunne tænkes at påvirke genfindelsen af den anden art. Disse forsøg blev udført i postevand, der blev tilsat hhv. 10.000 af den ene parasit og 100 af den anden og vice versa. For hver kombination blev der lavet 5 filtreringer. Desuden blev resultaterne af de positive kontroller, fra forsøg tilsat 10.000 af hver parasit, sammenlignet med interaktionsforsøgene, for at vurdere hvorvidt en samtidig høj koncentration af begge parasitter havde en negativ effekt på genfindelsesprocenten. Forsøg med råvand viste, at der ikke var den forventede genfindelse af Cryptosporidium oocyster. For at verificere at oocysterne blev fanget i filtret, blev der efter nogle enkelte filtreringer og inden IMS udtaget 50 µl af prøven på et objektglas. Prøven blev farvet efter fabrikantens forskrifter og aflæst i fluorescens mikroskop. I alle tilfælde kunne der påvises oocyster i prøven efter filtrering. Resultater Genfindelsesprocenten af cyster/oocyster blev ikke påvirket negativt ved høje koncentrationer af den ene eller begge parasitter, og var således ikke signifikant forskellig ved de forskellige koncentrationer af hhv. Giardia og Cryptosporidium. Denne observation muliggjorde en vurdering af genfindelsesprocenten for hver parasit i de undersøgte vandtyper uden korrektion for en evt. interaktion. For bedst muligt at kunne beregne genfindelsesprocenten for de to protozoarter i de respektive vandtyper blev den tilsatte mængde protozocyster hhv. -oocyster kontrolleret ved undersøgelse af 3 stikprøver for hver podningsdosis. Resultaterne af disse kontroltællinger varierede meget, men var ikke signifikant forskellig mellem de to protozoer. Genfindelsen af Giardia i råvand varierede mellem 39,3-77,3 % med et gennemsnit fra 54,6-62,3 %, og med størst variation i prøver med lav koncentration. Farvningen af Giardia cysterne var utilfredsstillende i alle råvandsprøverne. Genfindelsesprocenten for Giardia cyster i rent vand varierede mellem 26,8-63,4 % med et gennemsnit fra 41,5-52,8 % (figur 6). Variationen i genfindelsesprocenten var størst i prøverne med den laveste koncentration. Kun for Kingosvej prøver tilsat hhv. 1000 og 10.000 cyster var der en signifikant forskel (P < 0,05) sammenlignet med de øvrige rentvandsprøver, som i øvrigt ikke var forskellige fra hinanden. Udelades resultaterne for Kingosvej rent vand, som tydeligt lå lavere end resultaterne for de øvrige to rentvandstyper var genfindelsen mellem 48,9-59,4 %. Genfindelsen af Cryptosporidium i råvand varierede mellem 0,1-6,0 % med et gennemsnit fra 0,2-3,2 %. Variationen i genfindelsesprocenten var størst i prøver tilsat 100 oocyster. Genfindelsen af Cryptosporidium oocyster var for de tre rentvandstyper inden for et interval af 25-51,1 % med et gennemsnit fra 37,0-38,7 %. Den største variation i genfindelsesprocenten sås i prøver tilsat 100 oocyster, hvorimod standardafvigelsen i prøver tilsat 10.000 oocyster var mindre. Som det fremgår af ovenstående gjaldt det for både råvand og rent vand, at genfindelsen af Giardia var større end genfindelsen for Cryptosporidium. Dette kan skyldes, at Giardia cysterne er større og derfor lettere bliver opfanget af filtret. Desuden er det i henhold til producenten af IMS-kittet, Dynal Biotech, vist, at bindingen mellem Giardia og Dynabeads anti-Giardia er stærkere end bindingen mellem Cryptosporidium og Dynabeads anti-Cryptosporidium. Dette kan være årsagen til, at der i råvand genfindes mange Giardia cyster men ingen eller kun få Cryptosporidium oocyster. Det er et kendt problem, at Cryptosporidium oocyster og Giardia cyster har en tendens til at klumpe sammen og bundfælde, hvilket besværliggør en nøjagtig podning af prøverne. Generelt må det antages, at den store standardafvigelse i protozo-genfindelsen ikke mindst i prøver tilsat få oocyster/cyster er forårsaget af såvel en variation i mængden af tilsatte protozoer som en metode relateret (filtrering, IMS, fluorescens) variation. Råvandets kemiske og biologiske sammensætning udskiller sig på de fleste punkter ikke meget fra det rene vand. Der er dog en del jern især i Ejby råvand (3,7 mg/l), og selv i Kingosvej råvand (0,05-0,09 mg/l), som indeholder mindst af jern af de tre råvandstyperne, er der mere end i nogen af rentvandstyperne. For alle råvandstyper er der også betydeligt mere ammonium end i det rene vand. Derudover ser det ud til, at der i råvandet er mere bikarbonat og svovlilte end i det rene vand, men for disse parametre foreligger ikke værdier for alle vandtyperne. I modsætning til Giardia var der stort set ingen genfindelse af Cryptosporidium i råvand. Cryptosporidierne var påvist i prøven efter filtrering, hvorfor det må konkluderes at være IMS-opkoncentreringen, der ikke fungerede i råvand. Dette kunne evt. skyldes mængden af jern i råvandet eller den forholdsvis store mængde bundfald, selvom denne dog ikke overskrider Dynals forskrifter. Bindingen mellem Cryptosporidium oocysterne og Dynabeads anti-Cryptosporidium er ikke kraftig, og det kan tænkes, at stoffer i bundfaldet svækker bindingen yderligere. Der er ikke bestemt en nedre grænse for, hvad metoden kan detektere, men baseret på den fundne genfindelse for Cryptosporidium oocyster på minimum 25 % forventes det, at metoden kan detektere 2-3 oocyster i prøver med kun 10 oocyster. For Giardia kan metoden detektere 4-6 cyster ud af prøver med kun 10 cyster. Der er ved metodevalideringen ikke påvist en øvre begrænsning i antallet af oocyster/cyster, der kan detekteres, men denne er først og fremmest afhængig af IMSprocessen. SummaryThe purpose of this project was to optimise and validate a method for concentration, purification, and subsequent identification of the protozoans Cryptosporidium and Giardia in raw water and clean water, respectively. Background Interest in knowing the status of the content in water of the protozoans is partly based on the description of extensive waterborne epidemics caused by Cryptosporidium and Giardia in drinking water. Hence, increasing interest has arisen in the development and optimisation of methods to demonstrate these zoonotic parasites in different materials, including raw water and drinking water. Cryptosporidium parvum and Giardia lamblia (syn. G. intestinalis and G. duodenalis) are protozoans, which can infect the gastro-intestinal tract of both man and animals. The parasites are ubiquitous in nature and among the most common non-bacterial causes of diarrhoea. Cryptosporidia are excreted with the faeces as oocysts in great numbers. The oocysts are immediately infective and furthermore resilient towards all commonly employed disinfectants, including chlorine in the concentrations used for treatment of bathing and drinking water. In a cool, damp environment the oocysts may survive for several months. Infection occurs by direct contact (person-person, animal-human) or indirectly via ingestion of oocysts from e.g. drinking water, bathing water and foods contaminated with faecal material. Giardiasis in humans is caused by the species G. lamblia, which, similar to C. parvum, has a very wide host spectrum. The lifecycle encompasses two stages, the trophozoite, which is the infective form, and the cyst stage, which is the resistant form, or resting stage. The cyst stage is excreted with faeces and can survive for up to 2 months outside the host. For both protozoans, only few (oo) cysts are enough to cause illness. The method In this study a method has been optimised and validated to demonstrate Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts. The method has been validated through determination of the recovery rate by adding (spiking) a known number of oocysts and cysts to water samples. Six water samples of different quality were employed for the validation; three clean water samples from the waterworks at Kingosvej, Mørkskov, and Regnemark, plus three raw water samples from Kingosvej and Mørkskov waterworks as well as Ejby raw water drilling. Ten filtrations, each of 10 litres, have been performed with each of the following cyst/oocyst numbers added: 100, 1,000, and 10,000. Following every tenth filtration, a positive control (5 l pure water with addition of the same number of cysts/oocyst as the previous water sample, 100, 1,000 or 10,000) and a negative control (5 l pure water) were carried out. The water samples were filtered through a 2µm membrane filter, concentrated by centrifugation and immunomagnetic separation (IMS), and finally stained and read by immunofluorescence. In the course of the project, the methods for concentration and detection of Cryptosporidium and Giardia in water have been optimised at various stages. The rubber tubes were changed in the filtration process to ensure a protozoan-free status. When liberating the (oo)cysts from the filter in the 'pulsifier' employed, the volume of water as well as the general procedure were adjusted to minimize loss of (oo)cysts. The concentration of the filtrate was performed at an adjusted centrifugation configuration, and the process of microscopy was adjusted according to the sample content of (oo)cysts. As part of the validation it was examined whether there would be an interaction between Giardia and Cryptosporidium, such that, e.g., a high concentration of one might influence the recovery of the other. These experiments were carried out using tap water with addition of 10,000 of one protozoan and 100 of the other, and vice versa. For each combination 5 filtrations were performed. Additionally, the results of the positive controls from experiments with 10,000 (oo)cysts of each protozoan added were compared with the interaction experiments. Studies using raw water showed less than expected recovery of Cryptosporidium oocysts. To verify this, the oocysts were captured by the filter, and for some samples a 50µl sub-sample was extracted after filtration and before IMS. These sub-samples were stained for immunofluorescence microscopy according to the manufacturer's directions. In all cases, oocysts could be demonstrated in the sample. Results The recovery rate of (oo)cysts was not influenced negatively by a high concentration of one or both protozoans and was not significantly different at the different spiking levels of Giardia and Cryptosporidium, respectively. This observation enabled an evaluation of the recovery rate for each protozoan in the water types examined, without using a correcting factor for any interaction. In order to calculate the recovery rate for the two protozoans in the various water types, the spiking dose was checked by counting three sub-samples. The results of the dose counts varied considerably, but were not significantly different between the two protozoans. The recovery of Giardia in raw water varied between 39.3-77.3%, with an average of 54.6-62.3%, and with greatest variation in samples spiked with low numbers. The staining of the Giardia cysts was not satisfactory in any of the raw water samples. The recovery rate for Giardia cysts in clean water varied between 26.8-63.4% with an average of 41.5-52.8%. The variation in recovery rate was greatest in samples with low spiking dose. Only for samples from Kingosvej with 1,000 and 10,000 cysts added, respectively, was recovery significantly lower (P < 0.05) than that of the other clean water types, which did not differ. If the much lower Kingosvej clean water results were omitted, the recovery rate would be 48.9-59.4 %. The recovery of Cryptosporidium in raw water varied between 0.1-6.0%, with an average of 0.2-3.2%. The variation of the recovery rate was greatest in samples with 100 oocysts added. The recovery of Cryptosporidium oocysts from clean water samples was within an interval of 25-51.1%, with an average of 37.0-38.7%. The greatest variation was seen in samples with 00 oocysts added, whereas the standard deviation of samples spiked with 10,000 oocysts was less. As is described above, we found that for both raw water and clean water the recovery of Giardia was greater than that of Cryptosporidium. This may be due to the greater size of the Giardia cysts improving their capture on the membrane filter. Furthermore, the producer of the IMS kit, Dynal Biotech, states that the binding between Giardia and Dynabeads anti-Giardia is stronger than the binding between Cryptosporidium and Dynabeads anti-Cryptosporidium. This could be the reason that many Giardia cysts are recovered from raw water but no, or only few, Cryptosporidium oocysts. It is a well-known problem that Cryptosporidium oocysts as well as Giardia cysts have a tendency to clump together and sediment, which complicates a precise spiking of the samples. Generally it must be assumed that the large standard deviation of the recovery rates of the protozoans, not least in samples with 100 (oo)cysts added, is caused by both a variation in the actual spiking dose and a methodology-related (filtration, IMS, fluorescence labelling) variation. The chemical and biological constitution of the raw water types is generally not very different from that of the clean water. However, there is a considerable amount of iron, especially in Ejby raw water (3.7mg/l), and even in Kingosvej raw water (0.05-0.09mg/l), which contains the least iron of the three raw water types, the iron content is higher than in any of the clean water types. In all the raw water types, the content of ammonium is markedly higher than in the clean water samples. Additionally it appears that the raw water contains more bicarbonate and sulphur oxide than the clean water, although this data is not available for all the water types. In contrast to Giardia, the recovery of Cryptosporidium in raw water was practically non-existent. The cryptosporidia were demonstrated in sub-samples of filtration and hence we concluded that the IMS process did not function adequately in raw water. This could be related to the amount of iron in the raw water, or the significant amount of sediment which was characteristic of the raw water, even though the sediment amount did not exceed the IMS process directions. The binding between the Cryptosporidium oocysts and Dynabeads anti-Cryptosporidium is not strong and it is conceivable that compounds in the sediment further weaken the binding. No lower detection limit has been determined for the method, however, based on the recovery of Cryptosporidium oocysts of at least 25%, it is expected that the method may detect 2-3 oocysts in samples with only 10 oocysts. For Giardia the method can detect 4-6 cysts in samples containing only 10 cysts. This validation process has determined no upper detection limit, but it is likely to depend on the IMS process. 1 BaggrundBeskrivelsen af omfattende vandbårne epidemier forårsaget af Cryptosporidium og Giardia i drikkevand, har i den senere tid været en medvirkende årsag til stigende interesse for udvikling og optimering af metoder til påvisning af disse zoonotiske parasitter i forskellige materialer, herunder råvand og drikkevand. Cryptosporidium parvum og Giardia lamblia (syn. G. intestinalis og G. duodenalis) er encellede parasitter, der kan inficere mavetarm-kanalen hos såvel mennesker som dyr. Parasitterne er ubikvitært forekommende i naturen og blandt de almindeligste ikke-bakterielle årsager til diarré (Craun, 1990; Current & Garcia, 1991). C. parvum er den hyppigste årsag til cryptosporidiose hos pattedyr inklusive mennesker og opdeles i minimum 2 undergrupper: Genotype I, der kun er blevet påvist hos mennesker og andre primater; samt genotype II, der er vidt udbredt hos såvel dyr som mennesker. Cryptosporidiose er primært en infektion hos unge individer bl.a. kalve og lam, men også hunde og katte kan udgøre en smittekilde. Hos mennesker forekommer cryptosporidiose især hos børn under 5 år. Risikofaktorer er alder, underernæring, tilknytning til landbruget, rejseaktivitet, nedsat immunforsvar (kemoterapi, AIDS m.v.), men alle kan rammes. Cryptosporidier udskilles via fæces som oocyster indeholdende 4 sporozoiter. Oocysterne udskilles i meget store mængder, er straks infektive og endvidere modstandsdygtige overfor alle almindeligt anvendte desinfektionsmidler herunder klor i koncentrationer, der kan anvendes til behandling af drikke- / badevand. I køligt, fugtigt miljø kan oocysterne overleve flere måneder (Robertson et al., 1992). Smitte finder sted ved direkte kontakt (person-person, dyr-menneske) eller indirekte via optagelse af oocyster fra bl.a. drikkevand, badevand og levnedsmidler forurenet med fækalier. I mavetarmkanalen brister oocystevæggen og sporozoiterne trænger ind i tyndtarmens epithelceller, hvor opformeringen finder sted.
Figur 1. Giardiasis hos mennesker forårsages af arten G. lamblia, der i lighed med C. parvum har et meget bredt værtsspektrum. G. lamblia kan vha. molekylære teknikker inddeles i flere genotyper, hvoraf gruppe A og B har human betydning (Thompson et al., 2000). Livscyklus omfatter to stadier: Trophozoit stadiet, som er det infektive stadium og cyste stadiet, som er den resistente form, der udskilles med fæces (Figur 2). Cysten kan overleve op til 2 måneder udenfor værten (Tessier et al., 1999).
Figur 2. Den infektive dosis er lav for såvel C. parvum som G. lamblia, hhv. 9-1042 og 10-100 (Rendtorff, 1954; Dupont et al., 1995; Okhuysen et al., 1999). Infektionerne kan være asymptomatiske, men omfatter som regel opkastning og diarré. Hos normale individer med et velfungerende immunforsvar vil forløbet være tidsbegrænset med en varighed på 2-12 dage. Hos svækkede patienter vil symptomerne ved cryptosporidiose dog ofte være langt alvorligere, i mange tilfælde med dødelig udgang, idet der ikke findes nogen effektiv terapi. Infektioner med G. lamblia kan som regel behandles effektivt med metronidazol (Tessier et al., 1999; Martins & Guerrant, 1995). Det estimerede antal diagnosticerede humane tilfælde af cryptosporidiose og giardiasis i Danmark er hhv. 200 (anon., 2002) og 2000 årligt (Eskild Petersen, Statens Serum Institut, pers. komm.). Eftersom infektionerne ikke er anmeldepligtige, kendes den reelle incidens dog ikke. Større humane udbrud i udlandet af cryptosporidiose og giardiasis har primært været forårsaget af kontamineret drikkevand, såvel grundvand som overfladevand. I de fleste tilfælde er grundvandet blevet forurenet via nedsivende overfladevand, afløb fra marker, gylle og lign., mens årsagen til forurening af overfladevandet i mange tilfælde ikke har kunnet påvises (Smith & Ahmad, 1997; Fricker & Crabb, 1998). Fra udlandet kendes talrige vandbårne udbrud af cryptosporidiosis og giardiasis, herunder udbruddet i Milwaukee, der omfattede ca. 403.000 mennesker (MacKenzie et al., 1994; Fricker & Crabb, 1998). Som følge heraf er løbende kontrol med forekomsten af Cryptosporidium og Giardia i større vandværker og områder, hvorfra man tager overfladevand til drikkevand blevet påbudt i England og USA Sektion for parasitologi ved Danmarks Veterinærinstitut har på baggrund af flere års arbejde med protozoer en vis ekspertise indenfor området og har på Miljøstyrelsens foranledning ved tidligere lejligheder bl.a. undersøgt drikke- og spildevand for Cryptosporidium og Giardia med påvisning af protozoerne til følge. Miljøstyrelsen har derfor ønsket at få optimeret og valideret de anvendte opkoncentrerings- og detektionsteknikker. 2 MetodebeskrivelseI det nærværende studie er en metode til påvisning af Cryptosporidium oocyster og Giardia cyster blevet optimeret og valideret. Metoden er valideret via bestemmelse af genfindelsesprocenten ved tilsætning af kendte mængder oocyster og cyster i forskellige koncentrationer til vandprøverne. Til valideringen er anvendt 6 vandprøver af forskellig kvalitet. For hver vandprøve er der foretaget 10 filtreringer à 10 liter med hver af de følgende cyste/oocyste koncentrationer: 100, 1000 og 10.000. Vandprøverne er blevet filtreret, opkoncentreret vha. centrifugering og immunomagnetisk separation (IMS), og sluttelig farvet og aflæst vha. immunofluorescens. 2.1 Filtrering og opkoncentrering af vandprøverFormål Formålet med dette trin er at filtrere vandprøver (10 l) til undersøgelse for Cryptosporidium og Giardia. Opkoncentrering af filtratet sker vha. centrifugering, således at diagnostik via immunomagnetisk separation (IMS) og immunofluorescens (IF) efterfølgende kan foretages. Materialer Membranfilterholder, rustfrit stål, d: 142 mm (Millipore, DK) Positiv kontrol: 5 l ionbyttet (eller Milli-Q) vand tilsat 500 Cryptosporidium parvum oocyster ('Copenhagen calf laboratory isolate', CPB-0) samt 500 Giardia cyster (Giardia lamblia H3 isolat i 5% formalin/PBS, Waterborne Inc. New Orleans, USA) Negativ kontrol: 5 l ionbyttet vand. (Til validering af metoden er den positive kontrol blevet tilsat samme antal oocyster/cyster som de egentlige vandprøver.) Filtrering Generelt: Ved filtrering bruges handsker, og der arbejdes så sterilt som muligt. Filtre samt indvendig side af filterholderen berøres ikke.
NB. Efter hver 10. prøve medtages en negativ og en positiv kontrol. Efter en positiv kontrol skal filterholderen sendes til vask og autoklavering. Opkoncentrering ved centrifugering
2.2 Oprensning af Giardia cyster og Cryptosporidium oocyster fra vand vha. immunomagnetisk separationFormål Oprensning af Giardia cyster hhv. Cryptosporidium oocyster med henblik på efterfølgende detektion vha. immunofluorescens. De oprensede cyster/oocyster er relativt rene og derfor tillige velegnede til DNA ekstraktion oganalyse. Materialer Dynabeads GC-Combo kit (Dynal A/S, Norge) Forberedelse af reagenser Alle materialer inkl. vandprøven skal have stuetemperatur (15-25°C) Til hver prøve anvendes:
NB! Hvis bundfaldet i den enkelte prøve overstiger 0,5 ml svarende til ca. 5%, bør man ifølge Dynal's forskrifter fordele prøven i flere rør med hver maksimalt 0,5 ml bundfald og udføre IMS for samtlige prøver. Binding af Cryptosporidium og Giardia til Dynabeads
Dissociation af Dynabeads - cyste/-oocyste kompleks
Skulle den positive eller negative kontrol afvige fra det forventede, bør man kassere de pågældende prøver og starte forfra med filtreringen. Efter lufttørring bør man kun farve de prøver, som man forventer at kunne aflæse samme dag. U-farvede prøver kan opbevares på køl i op til et par dage. Ved længere opbevaring vil prøverne kunne miste evnen til at farves ordentligt. 2.3 Detektion af Cryptosporidium og Giardia vha. immunofluorescensFormål Detektion af Cryptosporidium / Giardia i oocyste/cyste suspensioner Materialer Merifluor Cryptosporidium / Giardia kit (Meridian Diagnostics, Inc.; Italien)
Farvning og aflæsning
Figur 3.
Tabel 1.
3 Metode optimeringI nærværende projekt er metoderne til opkoncentrering og detektion af Cryptosporidium og Giardia i vandprøver blevet optimeret mht. nedenstående punkter.
4 MetodevalideringTil validering af metoden blev anvendt 6 vandtyper af forskellig kvalitet: Tre rentvandsprøver fra hhv. Kingosvej, Mørkskov og Regnemark vandværk, samt 3 råvandsprøver fra Kingosvej og Mørkskov vandværk tillige med Ejby råvandsboring. Parametre for vandkvaliteten er angivet i Tabel 2, og en sammenfatning af vandkvaliteten er angivet nedenfor. Tabel 2. Ejby råvand: Vand med højt indhold af jern, kalk og ammonium. Desuden et middel niveau af metan samt NVOC. Regnemark rent vand: Vand med lave koncentrationer af jern, svovlbrinte og metan. Indholdet af NVOC ligger på grænseværdien på 4 mg/l. Ammonium indholdet er højt. Kingosvej råvand: Vandet med et højt indhold af metan og svovlbrinte samt noget (middel) ammonium. Kingosvej rent vand: Vand med et relativt højt indhold af organisk stof. Vandet opfylder kvalitetskravene til rent vand, dvs. metan og svovlbrinte fjernes. Ammonium er under grænseværdien. Mørkskov råvand: Vandet med et højt indhold af jern, samt noget ammonium (middel), svovlbrinte (middel) og metan (middel). Desuden relativt hårdt vand med et højt bikarbonatindhold. Mørkskov rent vand: Jern, metan og svovlbrinte formodes at være fjernet, således at grænseværdierne er overholdt (meget lave niveauer). Parasitmateriale Cryptosporidium parvum oocyster ('Copenhagen calf laboratory isolate', CPB-0) samt Giardia lamblia cyster (H3 isolat i 5% formalin/PBS, Waterborne Inc. New Orleans, USA) blev anvendt til podning af prøverne. For hver vandprøve blev der foretaget 10 filtreringer à 10 liter hver med følgende cyste/oocyste podningsdoser: 100, 1000 og 10.000. I alt blev der foretaget 30 filtreringer for hver vandtype (se tabel 3). Tabel 3.
Filtrering, oprensning og detektion blev gennemført ifølge metodebeskrivelsen. Prøverne blev farvet og aflæst senest 2 dage efter IMSoprensning. Til podning af vandprøverne blev oocyste/cyste brugs-opløsninger forberedt ud fra en stamopløsning med en kendt oocyste/cyste koncentration bestemt vha. hæmocytometer. Hver brugs-opløsning indeholdt det pågældende antal oocyster/cyster pr. ml som skulle tilsættes vandprøven. For at kontrollere den tilsatte dosis af hhv. Giardia cyster og Cryptosporidium oocyster, blev for hver ny podning parallelt udtaget 3 x 100 µl af brugs-opløsningerne på nogle Dynal spot-On objektglas. Disse stod til tørring, hvorefter de blev farvet ifølge forskriften. Podningsdosen blev udregnet fra gennemsnittet af de tre tællinger og resultaterne er anført i tabel 5. Som led i valideringen blev det undersøgt, hvorvidt der var interaktion mellem Giardia og Cryptosporidium, idet eksempelvis høj koncentration af den ene art kunne tænkes at påvirke genfindelsen af den anden art. Disse forsøg blev udført i postevand, der blev tilsat hhv. 10.000 af den ene parasit og 100 af den anden og vice versa. For hver kombination blev der lavet 5 filtreringer. Desuden blev resultaterne af de positive kontroller, fra forsøg tilsat 10.000 af hver parasit, sammenlignet med interaktionsforsøgene, for at vurdere hvorvidt en samtidig høj koncentration af begge parasitter havde en negativ effekt på genfindelsesprocenten. Forsøg med råvand viste, at der ikke var den forventede genfindelse af Cryptosporidium oocyster. For at verificere at oocysterne blev fanget i filtret, blev der efter nogle enkelte filtreringer og inden IMS udtaget 50 ml af prøven på et objektglas. Prøven blev farvet efter Merifluors forskrifter og aflæst i fluorescens mikroskop. I alle tilfælde kunne der påvises oocyster i prøven efter filtrering. 5 Resultater5.1 InteraktionsforsøgGenfindelsesprocenten af cyster/oocyster blev ikke påvirket negativt ved høje koncentrationer af den ene eller begge parasitter (tabel 4, figur 4), og var således ikke signifikant forskellig ved de forskellige koncentrationer af hhv. Giardia og Cryptosporidium. Denne observation muliggør vurdering af genfindelsesprocenten for hver parasit i de undersøgte vandtyper uden korrektion for en evt. interaktion. Tabel 4.
Figur 4. 5.2 Kontrol af den tilsatte podningsdosisFor bedst muligt at kunne beregne genfindelsesprocenten for de to protozoarter i de respektive vandtyper blev den tilsatte mængde protozocyster hhv. -oocyster kontrolleret ved undersøgelse af 3 stikprøver for hver podningsdosis. Resultaterne af disse kontroltællinger varierede meget, hvilket fremgår af den store standardafvigelse anført i tabel 5. Variationen er ikke signifikant forskellig mellem de to protozoer, uanset tallene er højere for Cryptosporidium end for Giardia. Tabel 5.
|
Ejby råvand |
Tilsat 100 oocyster/cyster |
Tilsat 1000 oocyster/cyster |
Tilsat 10.000 oocyster/cyster |
|||
|
Procent genfindelse |
|||||
Prøve- Nummer |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
1 |
9,0 |
34,0 |
1,8 |
34,8 |
0,3 |
67,3 |
2 |
4,0 |
39,0 |
1,5 |
41,7 |
0,3 |
62,0 |
3 |
3,0 |
26,0 |
1,3 |
67,9 |
0,0 |
70,1 |
4 |
8,0 |
20,0 |
0,6 |
52,2 |
0,3 |
64,8 |
5 |
5,0 |
65,0 |
0,4 |
22,6 |
0,1 |
46,3 |
6 |
9,0 |
36,0 |
0,5 |
58,0 |
0,1 |
65,3 |
7 |
5,0 |
47,0 |
0,1 |
64,2 |
0,0 |
62,9 |
8 |
11,0 |
33,0 |
0,1 |
68,5 |
0,0 |
54,0 |
9 |
3,0 |
40,0 |
0,1 |
61,1 |
0,2 |
48,3 |
10 |
3,0 |
53,0 |
0,0 |
45,9 |
0,1 |
44,5 |
Gennemsnit |
6,0 |
39,3 |
0,6 |
51,7 |
0,1 |
58,5 |
Standard- afvigelse |
3,0 |
13,1 |
0,7 |
15,3 |
0,1 |
9,4 |
Genfindelsesprocent
Den gennemsnitlige genfindelse for de tre cyste-koncentrationer af Giardia var hhv. 51,5, 63,4 og 50,5 %. For prøver tilsat 100 og 1000 cyster var standardafvigelsen forholdsvis stor. Genfindelsen i prøverne tilsat 1000 cyster var signifikant forskellig fra de 2 øvrige koncentrationer (P < 0,05). For Cryptosporidium var der ikke signifikant forskel mellem genfindelserne for de tre koncentrationer (gennemsnitlig hhv. 36,8, 39,7 og 37,2 % genfindelse).
Fluorescens
Oocysterne/cysterne fluorescerede hovedsageligt normalt. Enkelte cyster fluorescerede kun i kanten, men kunne tydeligt identificeres som Giardia.
Tabel 7.
Resultater af analyser af Regnemark rent vand tilsat hhv. 100, 1000 eller
10.000 protozocyster/oocyster.
Regnemark Rent vand |
Tilsat 100 oocyster/cyster |
Tilsat 1000 oocyster/cyster |
Tilsat 10.000 oocyster/cyster |
|||
|
Procent genfindelse |
|||||
Prøve- nummer |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
1 |
34,0 |
40,0 |
34,4 |
58,2 |
37,4 |
38,4 |
2 |
55,0 |
26,0 |
24,0 |
45,0 |
40,1 |
56,7 |
3 |
36,0 |
58,0 |
40,8 |
61,2 |
36,9 |
52,7 |
4 |
23,0 |
41,0 |
26,9 |
56,2 |
34,7 |
42,9 |
5 |
21,0 |
50,0 |
35,9 |
48,1 |
44,1 |
58,0 |
6 |
42,0 |
71,0 |
51,3 |
78,6 |
39,8 |
42,1 |
7 |
26,0 |
37,0 |
50,7 |
62,2 |
39,6 |
48,9 |
8 |
39,0 |
44,0 |
47,3 |
109,8 |
33,9 |
60,2 |
9 |
52,0 |
75,0 |
44,8 |
62,6 |
31,5 |
57,7 |
10 |
40,0 |
73,0 |
41,0 |
52,0 |
34,4 |
47,0 |
Gennemsnit |
36,8 |
51,5 |
39,7 |
63,4 |
37,2 |
50,5 |
Standard- afvigelse |
11,4 |
17,0 |
9,4 |
18,8 |
3,7 |
7,7 |
Mængden af bundfald var ca. 0,5 ml og faldt hermed indenfor IMS-produkt-vejledningens grænser.
Genfindelsesprocent
For prøver tilsat hhv. 1000 og 10.000 oocyster/cyster var den gennemsnitlige genfindelse af Giardia over 60 %. For prøver tilsat 100 cyster var genfindelsen blot 47,3 % med en relativt stor standardafvigelse. Genfindelsen for Cryptosporidium i denne vandtype var næsten 0 %.
Fluorescens
Farvningen af disse prøver var ikke optimal. Giardia fluorescerede overvejende rødt men med grønt i kanten.
Tabel 8.
Resultater af analyser af Kingosvej råvand tilsat hhv. 100, 1000 eller
10.000 protozocyster/oocyster.
Kingosvej Råvand |
Tilsat 100 oocyster/cyster |
Tilsat 1000 oocyster/cyster |
Tilsat 10.000 oocyster/cyster |
|||
|
Procent genfindelse |
|||||
Prøve- nummer |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
1 |
1,0 |
50,0 |
0,2 |
56,8 |
0,5 |
69,1 |
2 |
0,0 |
37,0 |
0,1 |
58,8 |
0,5 |
75,2 |
3 |
0,0 |
34,0 |
0,2 |
54,5 |
0,6 |
74,1 |
4 |
1,0 |
47,0 |
1,9 |
71,8 |
0,4 |
59,7 |
5 |
0,0 |
38,0 |
0,4 |
58,1 |
0,1 |
60,2 |
6 |
1,0 |
57,0 |
0,4 |
68,6 |
0,3 |
71,5 |
7 |
0,0 |
56,0 |
1,1 |
71,1 |
0,3 |
58,8 |
8 |
3,0 |
71,0 |
0,4 |
50,2 |
0,2 |
62,3 |
9 |
0,0 |
35,0 |
0,1 |
66,9 |
0,1 |
45,7 |
10 |
1,0 |
48,0 |
0,2 |
68,6 |
0,2 |
53,4 |
Gennemsnit |
0,7 |
47,3 |
0,5 |
62,5 |
0,3 |
63,0 |
Standard- afvigelse |
0,9 |
11,8 |
0,6 |
7,7 |
0,2 |
9,5 |
Genfindelsesprocent
For denne vandtype var den gennemsnitlige genfindelse for Giardia i prøverne med tilsat hhv. 1000 og 10.000 cyster lavere end for de øvrige rentvandstyper. Genfindelsen i prøver tilsat 10.000 cyster var signifikant lavere end i prøverne tilsat 100 hhv. 1000 cyster (P < 0,05). I de positive kontroller for prøverne med 1000 og 10.000 oocyster/cyster var genfindelsen på ca. 50-60%.
For at undersøge hvorvidt de lave genfindelser for Giardia i prøver med hhv. 1000 og 10.000 cyster skyldtes podningen eller evt. vandtypen, blev opsat et kontrol forsøg, som omfattede 7 x 10 liter vand undersøgt på samme måde som vandet i valideringsforsøgene. Genfindelsen for Giardia i kontrolforsøget (angivet som procent i forhold til genfindelsen i den positive kontrol) havde et gennemsnit på 92,9 % i forhold til valideringsforsøget, hvor gennemsnittet i forhold til den positive kontrol var 48,1 % (Figur 5).
Figur 5.
Resultaterne for genfindelsen af Giardia cyster i kontrolforsøget sammenlignet med
valideringsforsøget. Genfindelsen er angivet i procent i forhold til genfindelsen i den
positive kontrol (Standardafvigelsen angivet).
Resultaterne for de egentlige prøver tilsat hhv. 1000 og 10.000 oocyster/cyster kunne med kontrolforsøget ikke bekræftes og må derfor videre behandles med det forbehold, at de kan være misvisende, antagelig grundet variation i podningen.
Den gennemsnitlige genfindelse for Cryptosporidium oocysterne varierede fra 25 % i prøverne tilsat 100 oocyster til 35,6 % i prøverne tilsat 10.000 oocyster. Standardafvigelsen var relativt lille. Kun resultaterne for prøverne tilsat 100 oocyster var signifikant lavere end de øvrige (P < 0,05).
Fluorescens
Oocysterne/cysterne fluorescerede normalt.
Tabel 9.
Resultater af analyser af Kingosvej rent vand tilsat hhv. 100, 1000 eller
10.000 protozo-cyster/oocyster.
Kingosvej rent vand |
Tilsat 100 oocyster/cyster |
Tilsat 1000 oocyster/cyster |
Tilsat 10.000 oocyster/cyster |
|||
|
Procent genfindelse |
|||||
Prøve- nummer |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
1 |
28,0 |
38,0 |
31,1 |
40,3 |
37,9 |
31,0 |
2 |
30,0 |
33,0 |
24,8 |
48,4 |
35,1 |
28,5 |
3 |
29,0 |
47,0 |
35,0 |
57,8 |
38,7 |
29,9 |
4 |
22,0 |
45,0 |
35,9 |
38,4 |
36,7 |
26,9 |
5 |
12,0 |
74,0 |
37,1 |
48,3 |
39,0 |
30,0 |
6 |
31,0 |
37,0 |
38,4 |
40,1 |
36,6 |
26,0 |
7 |
21,0 |
50,0 |
33,9 |
32,7 |
37,3 |
23,5 |
8 |
22,0 |
57,0 |
30,5 |
37,9 |
25,3 |
13,1 |
9 |
34,0 |
61,0 |
26,7 |
20,9 |
31,0 |
34,2 |
10 |
21,0 |
48,0 |
29,8 |
32,1 |
38,8 |
24,9 |
Gennemsnit |
25,0 |
49,0 |
32,3 |
39,7 |
35,6 |
26,8 |
Standard- afvigelse |
6,5 |
12,4 |
4,5 |
10,2 |
4,3 |
5,8 |
Mængden af bundfald var ca. 0,5 ml.
Genfindelsesprocent
I denne vandtype var genfindelsesprocenten for Giardia generelt høj (gennemsnitlig 65,3-77,3 %) og for prøver tilsat 100 cyster markant højere end i de øvrige vandtyper. Dette skyldtes dels, at der var to prøver med meget høj genfindelse, men også at de øvrige prøver havde en lidt højere genfindelse end observeret for de øvrige vandtyper.
Genfindelseprocenten for Cryptosporidium var meget lav (gns. 0,1 - 3,0 %).
Fluorescens
Giardia cysterne blev farvet nogenlunde tilfredsstillende, idet de tydeligt fluorescerede grønt i kanten. Cirka 20% af cysterne fluorescerede helt grønt. De Cryptosporidium oocyster, der påvistes, fluorescerede normalt.
I prøver tilsat 1000 oocyster/cyster mangler et resultat pga. et ødelagt Dynal L10 rør.
Tabel 10.
Resultater af analyser af Mørkskov råvand tilsat hhv. 100, 1000 eller 10.000
protozocyster/oocyster.
Mørkskov råvand |
Tilsat 100 oocyster/cyster |
Tilsat 1000 oocyster/cyster |
Tilsat 10.000 oocyster/cyster |
|||
|
Procent genfindelse |
|||||
Prøve-nummer |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
1 |
2,0 |
77,0 |
manglende resultater |
0,0 |
71,3 |
|
2 |
0,0 |
71,0 |
0,1 |
54,0 |
0,2 |
65,7 |
3 |
7,0 |
73,0 |
0,7 |
71,5 |
0,1 |
70,2 |
4 |
7,0 |
48,0 |
0,1 |
69,8 |
0,1 |
69,8 |
5 |
2,0 |
57,0 |
0,0 |
63,2 |
0,0 |
76,7 |
6 |
2,0 |
69,0 |
0,2 |
64,9 |
0,1 |
46,9 |
7 |
1,0 |
66,0 |
0,1 |
67,5 |
0,1 |
58,4 |
8 |
6,0 |
134,0 |
0,2 |
62,5 |
0,0 |
80,8 |
9 |
2,0 |
57,0 |
0,2 |
72,0 |
0,0 |
58,7 |
10 |
1,0 |
121,0 |
0,3 |
65,8 |
0,0 |
54,3 |
Gennemsnit |
3,0 |
77,3 |
0,2 |
65,7 |
0,1 |
65,3 |
Standard- afvigelse |
2,6 |
28,0 |
0,2 |
5,6 |
0,1 |
10,6 |
Genfindelsesprocent
Den gennemsnitlige genfindelse for Giardia for de tre koncentrationer var 47,4-55,4 %, med en forholdsvis høj standardafvigelse for prøver tilsat 100 cyster. Kun mellem prøver tilsat hhv. 1000 og 10.000 cyster var der en signifikant forskel (P < 0,05).
Den gennemsnitlige genfindelse for Cryptosporidium var 38,1-51,1 %; signifikant lavere for prøver der var tilsat 10.000 oocyster i forhold til prøver tilsat 100 oocyster (P < 0,05).
Fluorescens
Oocysterne/cysterne fluorescerede normalt. Cirka halvdelen af prøverne blev ikke farvet og aflæst før 5-6 dage efter IMS, hvilket tydeligt reducerede graden af fluorescens. Alle prøverne kunne dog aflæses uden besvær.
Tabel 11.
Resultater af analyser af Mørkskov rent vand tilsat hhv. 100, 1000 eller 10.000
protozocyster/oocyster
Mørkskov rent vand |
Tilsat 100 oocyster/cyster |
Tilsat 1000 oocyster/cyster |
Tilsat 10.000 oocyster/cyster |
|||
|
Procent genfindelse |
|||||
Prøve-nummer |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
Cryptospo- ridium |
Giardia |
1 |
47,0 |
52,0 |
43,2 |
60,7 |
32,9 |
42,5 |
2 |
66,0 |
47,0 |
60,3 |
60,0 |
47,9 |
56,3 |
3 |
63,0 |
73,0 |
43,4 |
56,8 |
39,9 |
52,9 |
4 |
54,0 |
33,0 |
37,2 |
50,7 |
40,2 |
52,3 |
5 |
45,0 |
50,0 |
40,2 |
60,5 |
36,3 |
47,4 |
6 |
58,0 |
55,0 |
47,5 |
62,8 |
41,6 |
45,7 |
7 |
45,0 |
50,0 |
42,7 |
55,2 |
38,0 |
43,2 |
8 |
43,0 |
56,0 |
37,2 |
49,5 |
30,9 |
44,9 |
9 |
52,0 |
42,0 |
48,1 |
57,2 |
37,5 |
46,2 |
10 |
38,0 |
25,0 |
40,2 |
40,8 |
36,1 |
42,5 |
Gennemsnit |
51,1 |
48,3 |
44,0 |
55,4 |
38,1 |
47,4 |
Standard- afvigelse |
9,1 |
13,1 |
6,8 |
6,7 |
4,8 |
4,8 |
Giardia
Genfindelsen af Giardia i råvand varierede mellem 39,3-77,3 % med et gennemsnit fra 54,6-62,3 %, og med størst variation i prøver med lav koncentration. Farvningen af Giardia cysterne var utilfredsstillende i alle råvandsprøverne.
Genfindelsesprocenten for Giardia cyster i rent vand varierede mellem 26,8-63,4 % med et gennemsnit fra 41,5-52,8 % (figur 6). Variationen i genfindelsesprocenten var størst i prøverne med den laveste koncentration. Kun for Kingosvej prøver tilsat hhv. 1000 og 10.000 cyster var der en signifikant forskel (P < 0,05) sammenlignet med de øvrige rentvandsprøver, som i øvrigt ikke var forskellige fra hinanden. Udelades resultaterne for Kingosvej rent vand, som tydeligt lå lavere end resultaterne for de øvrige to rentvandstyper var genfindelsen mellem 48,9-59,4 %.
Cryptosporidium
Genfindelsen af Cryptosporidium i råvand varierede mellem 0,1-6,0 % med et gennemsnit fra 0,2-3,2 %. Variationen i genfindelsesprocenten var størst i prøver tilsat 100 oocyster.
Genfindelsen af Cryptosporidium oocyster var for de tre rentvandstyper inden for et interval af 25-51,1 % med et gennemsnit fra 37,0-38,7 % (Figur 6). Den største variation i genfindelsesprocenten sås i prøver tilsat 100 oocyster, hvorimod standardafvigelsen i prøver tilsat 10.000 oocyster var mindre (Figur 7).
Figur 6.
Den gennemsnitlige genfindelse af cyster/oocyster for de tre rentvandstyper
(95% Konfidens interval). Øverst: Cryptosporidium. Nederst: Giardia
Figur 7.
Den gennemsnitlige genfindelse (95% Konfidens interval) for Cryptosporidium
og Giardia i hhv. råvand og rent vand.
For både råvand og rent vand gælder det, at genfindelsen af Giardia er større end genfindelsen for Cryptosporidium. Dette kan skyldes, at Giardia cysterne er større og derfor lettere bliver opfanget af filtret. Desuden er det i henhold til Dynal Biotech vist, at bindingen mellem Giardia og Dynabeads anti-Giardia er stærkere end bindingen mellem Cryptosporidium og Dynabeads anti-Cryptosporidium. Dette kan være årsagen til, at der i råvand genfindes mange Giardia cyster men ingen eller kun få Cryptosporidium oocyster.
For hver gang prøverne blev podet blev koncentrationen af stamopløsningen kontrolleret. Tallene for Giardia koncentrationerne lå ofte under det forventede på hhv. 100, 1000 og 10.000 pr. ml stamopløsning. Til trods for dette var genfindelses resultaterne for de testede vandprøver omkring det forventede niveau. Der er muligvis sket en udvaskning af nogle Giardia cyster under farvning, omend dette ikke synes at være tilfældet ved farvning af de egentlige prøver.
Det er et kendt problem, at Cryptosporidium oocyster og Giardia cyster har en tendens til at klumpe sammen og bundfælde, hvilket besværliggør en nøjagtig podning af prøverne. Generelt må det antages, at den store standardafvigelse i protozo-genfindelsen ikke mindst i prøver tilsat få oocyster/cyster er forårsaget af såvel en variation i mængden af tilsatte protozoer som en metode relateret (filtrering, IMS, fluorescens) variation. Samtidig kan de påviste forskelle i genfindelsen i forhold til koncentrationen, formentlig i nogen grad tillægges usikkerhed forbindelse med podning af prøverne.
Råvandets kemiske og biologiske sammensætning udskiller sig på de fleste punkter ikke meget fra det rene vand. Der er mere jern i råvandstyperne end i nogen af rentvandstyperne, især i Ejby råvand (3,7 mg/l) men også i Kingosvej råvand (0,05-0,09 mg/l), som i øvrigt indeholder mindst jern af de tre råvandstyper. For alle råvandstyper er der også betydeligt mere ammonium end i det rene vand. Derudover ser det ud til, at der i råvandet er mere bikarbonat og svovlilte end i det rene vand, men for disse parametre foreligger ikke værdier for alle vandtyperne.
I modsætning til Giardia var der stort set ingen genfindelse af Cryptosporidium i råvand. Cryptosporidierne var påvist i prøven efter filtrering, så derfor må det konkluderes at være IMS-opkoncentreringen, der ikke fungerede i råvand. Dette kunne evt. skyldes mængden af jern i råvandet eller den forholdsvis store mængde bundfald, selvom denne dog ikke overskrider Dynals forskrifter. Bindingen mellem Cryptosporidium oocysterne og Dynabeads anti-Cryptosporidium er ikke kraftig, og det kan tænkes, at stoffer i bundfaldet svækker bindingen yderligere.
Immunofluorescens farvningen af Giardia var ikke optimal i råvand. Op til 50% af cysterne i Ejby råvand blev ikke farvet, mens en stor del af resten kun blev farvet delvist. I mange tilfælde var det kun muligt at identificere Giardia, fordi det på forhånd var kendt, at elementer af pågældende størrelse og form i disse prøver kun kunne være denne parasit. I vandprøver med ukendt forekomst er denne dårlige farvning ikke acceptabel, da kun grønt fluorescerende / specifikt mærkede organismer bør registreres. For de øvrige råvandstyper var farvningen bedre men stadig ikke på samme niveau som i rent vand. På baggrund af nærværende resultater må det konkluderes, at metoden ikke er anvendelig til påvisning af Cryptosporidium og Giardia i råvand, da den vil kunne føre til falske negative resultater.
Cirka halvdelen af rentvandsprøverne fra Mørkskov vandværk blev ikke farvet og aflæst før 5-6 dage efter IMS, hvilket tilsyneladende havde mindsket deres evne til at fluorescere. Alle prøverne var dog mulige at aflæse.
I rent vand var der for 3 vandtyper (inkl. interaktionsforsøget, hvor der blev brugt postevand) en gennemsnitlig genfindelse på ca. 35 % for Cryptosporidium og ca. 50% for Giardia. For én rentvandstype (Kingosvej) var genfindelsen for Giardia dog noget lavere i prøver med hhv. 1000 og 10.000 oocyster/cyster. På baggrund af kontrolforsøget, hvor resultaterne viste en cirka dobbelt så stor genfindelse i forhold til den positive kontrol, må det antages, at den lave genfindelse af Giardia skyldes en fejl i tilsætning af Giardia cyster til prøverne. Det er, som nævnt, kendt at (oo)cyster tenderer til at være ujævnt fordelt i en væske og problemer med dette har ført til, at man f.eks. for oocyster anbefaler anvendelse af flowcytometer til tælling og dispensering af oocysterne ved spiking af vandprøver (f.eks. Sturbaum et al., 2002). Herved kan opnås et helt præcist kendskab til den tilsatte mængde oocyster og minimering af podningsdosering som fejlkilde.
Resultaterne af denne undersøgelse afviger ikke fra, hvad der tidligere er beskrevet. Således blev i engelske sammenlignende studier af oocyste- hhv. cyste-genfindelsen efter filtrering af spikede (ca. 100 (oo)cyster pr 10 l) vandprøver genfundet 10-41% oocyster hhv. 22-52% cyster ved brug af 1,2 mm pore membranfilter og ubetydeligt færre ved brug af 3,0 µm pore membranfilter (Shepherd & Wyn-Jones, 1996). Tilsvarende resultater er opnået ved Taiwanske analyser af såvel råvand som renset vand for de 2 protozoer, nemlig med en genfindelse på 16-17% oocyster hhv. 38-40% cyster. Det blev tillige fundet, at detektionsgrænsen for organismerne i råvand med høj turbiditet var betydeligt højere end i renset vand (altså en lavere sensitivitet) (Hsu et al., 2001).
I de omtalte undersøgelser blev ikke anvendt IMS-oprensning, men udelukkende filtrering og efterfølgende IFAT. Ved studier af genfindelsen af (oo)cyster fra vand af varierende turbiditet under anvendelse af IMS er beskrevet genfindelser af oocyster hhv. cyster på 56-83% hhv. 61-89% (McCuin et al., 2001). Disse genfindelser er højere end hvad vi har fundet - men undersøgelserne er foretaget på prøver efter justerende fortyndinger til frembringelse af analyserbart materiale. Sådanne justeringer synes ikke relevante til brug ved rutinemæssige undersøgelser.
Der er ikke bestemt en nedre grænse for, hvad metoden kan detektere, men baseret på den fundne genfindelse for Cryptosporidium oocyster på minimum 25 % forventes det, at metoden kan detektere 2-3 oocyster i prøver med kun 10 oocyster. For Giardia kan metoden detektere 4-6 cyster ud af prøver med kun 10 cyster. Der er ved metodevalideringen ikke påvist en øvre begrænsning i antallet af oocyster/cyster, der kan detekteres, men denne er først og fremmest afhængig af IMS-processen. Da formålet med analysen snarere er vurdering af parasitternes forekomst end kvantitering af store antal, er yderligere afgrænsning ikke relevant.
Fordelene ved den her beskrevne metode er, at det kun er nødvendigt at filtrere forholdsvis små mængder vand, i forhold til andre metoder hvor der skal filtreres op til 1000 l vand (Baker et al., 1998). Den lille vandmængde betyder, at selve filtreringen kan foregå på et laboratorium i stedet for ude på selve vandværket. Metoden er nem at bruge og kræver ikke meget oplæring. Det meste af det nødvendige udstyr er standard laboratorium udstyr. Genfindelsen ved brug af denne metode er relativt stabil og samtidig relativt høj i forhold til ved brug af andre metoder, hvor genfindelsen kan være helt ned til 3% (Hansen & Stenström, 1998).
Metodens største ulempe er, at den er forholdsvis tidskrævende.
Rapporten beskriver optimering og validering af en metode til detektion af protozoerne Cryptosporidium og Giardia i vand. Metoden er baseret på filtrering af 10 liter vand igennem et membranfilter, opkoncentrering af protozoerne vha. centrifugering og immunomagnetisk separation (IMS) og efterfølgende mærkning af protozoerne med immunofluorescens til aflæsning af prøverne vha. fluorescensmikroskopi.
Ved brug af denne metode til påvisning af Giardia og Cryptosporidium i rent vand vil man kunne forvente at finde ca. 35% af Cryptosporidium oocysterne og ca. 50% af Giardia cysterne. Herudfra må det konkluderes, at det med den beskrevne metode vil være muligt at påvise forekomst af protozoer ned til en koncentration på 10 oocyster/cyster pr. 10 l rent vand. Ved denne forekomst vil da kunne påvises 2-3 Cryptosporidium oocyster og 5 Giardia cyster.
Den øvre grænse for, hvad metoden kan detektere, er først og fremmest afhængig af IMSprocessen.
Metoden kan kun anbefales til test af rentvandsprøver, da den i råvand ikke kan påvise Cryptosporidium oocyster og der tillige er en dårlig farvning af Giardia cysterne, hvilket ikke er acceptabelt i prøver med ukendt status.
Anonym, 2002. Annual Report on Zoonoses in Denmark 2001, Ministry of Food, Agriculture and Fisheries.
Baker, J.R., Muller, R. & Rollinson, D. (eds.). 1998. Advances in parasitology. Opportunistic protozoa in humans. Academic Press, San Diego, USA.
Bemrick, W.J. & Erlandsen, S.L. 1988. Giardiasis - is it really a zoonosis? Parasitology Today, 4: 69-71.
Craun, G.F. 1990. Waterborne giardiasis, p 267-293. In E. A. Meyer (ed.), Giardiasis. Elsevier Science Publishers, Amsterdam. Current, W.L. & Garcia, L.S. 1991. Cryptosporidiosis. Clinical Microbiology Reviews, 4: 325-358.
DuPont, H.L., Chappell, C.L., Sterling, C.R., Okhuysen, P.C., Rose, J.B. & Jakukowski, J.B., 1995. The infectivity of Cryptosporidium parvum in healthy volunteers. The New England Journal of Medicine, 322: 855-859.
Fricker, C.R. & Crabb, 1998. Water-borne cryptosporidiosis: detection methods and treatment options. Advances in Parasitology 40: 240-278.
Hansen, A. & Stenström, T.A. 1998. Kartläggning av Giardia och Cryptosporidium i svenska ytvattentäkter. Smittskyddsinstitutet och Livsmedelsverket.
Hsu, B., Huang, C., Hsu, Y., Jiang, G. & Hsu, C.L. 2001. Evaluation of 2 concentration methods for detecting Giardia and Cryptosporidium in water. Water Research, 35: 419-424.
MacKenzie, W., Hoxie, N., Proctor, M., Gradus, M., Blair, K., Peterson, D., Kazmierczak, J., Addiss, D., Fox, K., Rose, J., Davis, J. 1994. A massive outbreak in Milwaukee of Cryptosporidium infection transmitted through the public water supply. The New England Journal of Medicine, 331: 161-167.
Martins, C.A.P. & Guerrant, R.L. 1995. Cryptosporidium and cryptosporidiosis. Parasitology Today, 11: 434-436.
McCuin, R.M., Bukhari, Z., Sobrinho, J. & Clancy, J.L. 2001. Recovery of Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts from source water concentrates using immunomagnetic separation. Journal of Microbiological Methods, 45: 69-76.
Okhuysen, P.C., Chapell, C.L., Crabb, J.H., Sterling, C.R., Dupont, H.L. 1999. Virulence of three distinct Cryptosporidium parvum isolates for healthy adults. The Journal of Infectious Diseases 180: 1275-1281. O'Donoghue, P.J. 1995. Cryptosporidium and Cryptosporidiosis in Man and Animal. International Journal for Parasitology, 25: 139-195.
Rendtorff, R.C. 1954. The experimental transmission of human intestinal protozoan parasites: II. Giardia lamblia cysts given in capsules. American Journal of Hygiene, 59: 209-220.
Robertson, L.J. Campbell, A.T. & Smith, H.V. 1992. Survival of Cryptosporidium parvum oocysts under various environmental pressures. Applied and Environmental Microbiology, 58: 3494-3500.
Shepherd, K.M. & Wyn-Jones, A.P. 1996. An evaluation of methods for the simultaneous detection of Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts from water. Applied and Environmental Microbiology, 62: 1317-1322.
Smith, H.V. & Ahmad, R. 1997. Protozoan parasites in the water. Parasitology Today, 13: 3-4.
Smith, H.V. & Rose, J.B. 1998. Waterborne Cryptosporidiosis: Current Status. Parasitology Today, 14: 14-22.
Sturbaum, G.D., Klonicki, P.T., Marshall, M.M., Jost, B.H., Clay, B.L. & Sterling, C.R. 2002. Immunomagnetic separation (IMS)-fluorescent antibody detection and IMS-PCR detection of seeded Cryptosporidium parvum oocysts in natural waters and their limitations. Applied and Environmental Microbiology, 68:2991-2996.
Tessier, J.L. & Davies, G.A.L. 1999. Giardiasis. Primary Care Update for OB/GYNS, 6: 8-11.
Thompson, R.C.A., Hopkins, R.M., Homan, W.L. 2000. Nomenclature and genetic groupings of Giardia infection mammals. Parasitology Today, 16: 210-213.
Formål
At beskrive funktioner, anvendelse og vedligeholdelse af filterholderen.
Anvendelse
Filterholderen bruges ved filtrering af vandprøver, for påvisning af protozoer. Figur 1 viser filterholderen. Der er i det følgende refereret til figuren.
Apparatur
Den originale udløbsstuds i bundpladen er blevet erstattet med et længere rør i rustfrit stål.
Dette rør er ført igennem en gummiprop, så holderen kan anbringes på en sugekolbe.
Sugekolben tilsluttes, via et forlag, vakuumhanen i laboratorielokalet.
Brugsvejledning
Filterholderen samles.
I toppladen er der anbragt en studs (fig. 8, 1) til tilløb af vand.
I top- og bundplade er der desuden anbragt to ventiler (fig. 8, 3), der skal forhindre for stort undertryk i filterholderen.
Filtrering
Efter autoklavering skal man undgå at røre ved tilløbsstudsen (fig. 8, 1).
Rengøring
De enkelte dele anbringes i varmt vand med sæbe og vaskes med en blød børste.
De vaskede dele skylles i varmt vand og bagefter i destilleret vand.
De enkelte dele stilles til tørring i varmeskab eller stilles til lufttørring.
Der må ikke bruges viskestykker eller andre klæder til aftørring af filterholderen, idet der kan efterlades trådrester o.lign. på de enkelte dele af filterholderen.
Filterholderen samles anbringes i en autoklavepose eller pakkes ind i autoklavepapir og autoklaveres ved 120 oC i 20 minutter.
Figur forklaring:
1. Til- og afløbsstuds. 2. Topplade. 3. Trykventiler. 4. Silikone O-ringe.
5. Filterholderskærm. 6. Filterstøtteskærm. 7. Afdræningsskærm. 8. Bundplade. 9. Ben