3 Program til statistisk databehandling

Statistisk analyse og biologisk tolkning af toksicitetsdata

Pakken drc er en udvidelsespakke til statistikprogrammet R, som er open source og platform-uafhængig (http://www.r-project.org ). Opbygningen af R gør det relativt nemt at lave udvidelsespakker, der specialiserer sig på områder, som ikke er dækket af den funktionalitet, som standardinstallation af R kommer med. Der findes lige nu mere end 1000 sådanne udvidelsespakker. Alle disse er underkastet ganske strenge krav vedrørende format, dokumentation og struktur, mens en egentlig validering af hver enkelt pakke typisk foregår gennem software-evaluering i specialiserede tidsskrifter og især gennem feedback fra brugere. Pakken drc har været igennem et software-evaluering i 2005 i forbindelse med publikationen (Ritz and Streibig, 2005). Funktionaliteten af drc er siden blevet væsentlig udvidet. På det seneste er det i høj grad sket gennem nærværende projekt, hvor problemstillinger og tilbagemeldinger fra projektgruppens medlemmer har bidraget til, at drc i dag fremstår som et væsentligt alternativ til eksisterende kommercielle programmer.

Pakken fokuserer på analyse af dosis-responsdata vha. regressionsmodeller for binær og kontinuert respons. I programpakken kan en række parametriske dosis-responsmodeller specificeres og estimeres, uden at brugeren skal bekymre sig om de tekniske aspekter, der ligger bagved (beregningsprocedurer, vælg af startværdier for parametrene i den ikke-lineære regression mm.). Estimationen er baseret på maximum likelihood-princippet. Dertil kommer funktionalitet, som ud fra en tilpasning af en dosis-responsmodel kan beregne vilkårlige ED-værdier eller relative styrker (relative potencies), når flere kurver betragtes. De tilhørende estimerede standardafvigelser og/eller konfidensintervaller kan også beregnes. Desuden er det muligt at visualisere data og modeltilpasningen grafisk. De fleste af de data der er vist i denne rapport findes som datasæt i drc pakken