Bilag 5, Miljøstyrelsen

[Forside] [Indhold] [Udskriftsvejledning][Tilbage]

Påvisning af virus i vand og toskallede bløddyr

Bilag 5 Metoder til påvisning af virus, fordele og ulemper

Påvisningsmetode	Fordele	Ulemper	Påviste virustyper/ detektionsgrænse	Reference
Cellekulturer	Påviser infektiøse virus	Metoden er tidskrævende Cellekulturer er følsomme overfor celletoksiske stoffer i vandprøver Hepatitis A virus og nogle adenovirus er langsomt voksende i cellekulturer Norwalk virus kan ikke dyrkes i cellekulturer
EIA (enzyme immunosorbent assay)	Metoden er hurtig Mindre følsom overfor kemiske komponenter i prøvemateriale Kan påvise fx adenoviurs som er langsomt voksende i cellekulturer	Metodens følsomhed kan være meget varierende Påviser virus antigen. Der kan ikke skelnes mellem infektiøse eller inaktive virus	Rotavirus, 10 PFU/ml Adenovirus, 10 TCID₅₀/ml	Dahling et al., 1993
PCR/RT-PCR	Metoden har en høj sensitivitet og specificitet Kan påvise ikke dyrkbare virus, Norwalk virus og vanskeligt dyrkbare virus, hepatitis A virus og adenovirus	Metoden er meget følsom overfor kemiske komponenter i vandprøver, som kan inhibere PCR reaktion og medføre falsk negative resultater eller non-specifikke reaktioner PCR kan inhiberes af beef extract, som anvendes i filteradsorption- elueringsprocesser	Poliovirus/0.1 PFU pr. liter grundvand Coxsackievirus A17 og A20 samt Echovirus 16/0,003-0,6 TCID₅₀ pr. 10 m l prøvekoncentrat (spildevand) Hepatitis E virus, Rotavirus Poliovirus 1/0,15 PFU pr. liter drikkevand Norwalkvirus	Abbazadegan et al., 19936 Shieh et al., 1995 Jothikumar et al., 1995 Woolfaardt et al., 1995
Seminested og nested PCR/RT-PCR	Samme fordele som ved PCR/RT-PCR, men sensitivitet og specificitet er forøget Inhiberende substanser fortyndes i den sekundære PCR	Samme ulemper som ved PCR/RT-PCR	Coxsackievirus B₃ og poliovirus 1/0,2 PFU pr. liter drikkevand Enterovirus Hepatitis A virus Adenovirus	Ju-fang et al., 1995 Guydar et al., 1995 Puig et al., 1994