Oversigt over forskellige metoder til påvisning af virus i toskallede bløddyr,
tabel 2:
Metode
(refe-
rencer) |
Fordele |
Ulemper |
Detektions-
grænse |
RT-PCR
(48,49) |
- høj sensitivitet
- hurtig
- en bred vifte af virus påvises
|
- detekterer virusnukleinsyre (infektivt/
non-infektivt)
- risiko for falske negative svar pga. PCR-
inhibitorer
|
4200 kopier af RNA-
genom/1,5 g væv |
Antigen capture RT-PCR
(51) |
- høj sensitivitet
- hurtig
- RT-PCR på nukleinsyre fra viruspartikler
- ingen tidskrævende RNA ekstrahe-
ringer
- PCR inhibitorer elimineres
|
- problemer med at fremstille velegnede bredt reagerende Norwalk virus
antistoffer
|
|
Semi-
nested RT-PCR
(38) |
- generelt højere sensitivitet end konventionel RT-PCR
|
- jf. konven-
tionel RT-
PCR
|
1200 virus-
nukle-
insyre/g væv |
Hybridise-
ringsassay |
- øger sensitivitet af RT-PCR
|
- bør laves i kombination med RT-PCR
|
|
Celle-
kultur |
|
- cytotoksiske stoffer i toskallede bløddyr kan hæmme virusvækst
generelt
- tidskrævende
- Norwalk virus ikke dyrkbare
- vildtype hepatitis A virus gror dårligt og langsomt i cellekultur
|
|
Elektron-
mikro-
skopi |
- virusmor-
fologi iagttages
|
- specificitet, f.eks. er Norwalk virus vanskelig at identificere
- lav sensitivitet
|
106 viruspar-
tikler/g |